La Universidad de Bogotá Jorge Tadeo Lozano se funda en 1954 como respuesta tanto al momento histórico como a las necesidades que en recursos naturales tenía el país. Los estragos de la violencia, la dictadura de Rojas Pinilla y la crisis de la Universidad indujeron a Joaquín Molano Campuzano, Javier Pulgar Vidal y Jaime Forero Valdés a crear una institución que formara "generaciones nuevas desprovistas de sectarismo, fanatismo y odio, con una conciencia plena sobre el valor inconmensurable de los recursos humanos y naturales" (J. Molano). El 5 de febrero de 1954 fundan entonces la Tadeo con el objetivo de "continuar la obra cultural y científica comenzada por la Expedición Botánica". En ese momento se crea las primeras facultades, las fueron Indoamericana de Recursos Naturales, Economía, Estadística y Administración, Geografía, Topografía y Cartografía, el Instituto de Política Internacional y por último Historia y Diplomacia.
El nueve de mayo de 2006, mediante el acuerdo nueve el Consejo Directivo de la Universidad, desarrolla la reorganización de la estructura académica de la Universidad, mediante la creación de las cuatro facultades, entre ellas la Facultad de Ciencias Económicas y Administrativas. Igualmente, se señala que la facultad estará integrada por programas de pregrado y postgrado. Así mismo, cada facultad asumirá las actividades de docencia, investigación y proyección social.
Actualmente, el objetivo de la Facultad de Ciencias Económicas y Administrativas es el de preservar, generar y difundir conocimiento en las áreas de su competencia, a saber, la administración, la contaduría y la economía; formar personas competentes con estándares de alta calidad; innovar sus programas académicos y los procesos de enseñanza-aprendizaje, consultando las fronteras de las ciencias que los respaldan; prestar los servicios docentes, investigativos, de consultoría y de proyección social que requiera la sociedad.
Con la resolución No. 037 del 7 de diciembre de 2015, se establece la Estructura Orgánica de las Facultades y la Facultad de Ciencias Económicas y Administrativas quedo con la siguiente estructura:
- Departamento Economía, Comercio Internacional y Política Social.
- Escuela de Administración, Contaduría y Mercadeo.
Programas de Economía y Comercio Internacional que agrupa: Programa de Tecnología en Gestión de Exportaciones e Importaciones, Economía, Comercio Internacional y Finanzas, Maestría en Economía y Maestría en Comercio Internacional.
Programas de Administración que agrupa: Programa de Tecnología en Gestión del Transporte, Administración de Empresas, Administración de Empresas Agropecuarias, Especialización Gerencia de Transporte, Especialización Gerencia del Talento Humano, Especialización Gerencia Financiera, Especialización Gerencia en Gobierno y Gestión Pública y Especialización Gerencia Logística Comercial Nacional e Internacional.
Programas de Contaduría Pública que agrupa: Programa de Contaduría Pública, Especialización Administración y Auditoría Tributaria y Especialización Estándares Internacionales de Contabilidad y Auditoría.
Programas de Mercadeo que agrupa: Programa de Mercadeo y Especialización Gerencia de Mercadeo.
Programas de Posgrados en Salud que agrupa: Programa de Especialización Gerencia y Auditoría de la Calidad en Salud, Especialización en Gestión de la Seguridad y Salud en el Trabajo, Especialización en Economía y Gestión de la Salud y Maestría en Gestión y Política de la Salud.
Las líneas de investigación de la Facultad de Ciencias Económicas y Administrativas serán aprobadas y actualizadas por el Consejo Académico, previa solicitud del Comité de Facultad.
Las líneas de investigación se revisarán y actualizarán de acuerdo con la evolución y requerimientos de la Facultad.